วัดแม่ตะไคร้ เป็นวัดเก่าแก่ที่สร้างขึ้นตั้งแต่ปี พ.ศ.2391 เนื่องจากวัดตั้งอยู่ท่ามกลางป่าลึกเป็นอุปสรรคต่อการเดินทาง รวมถึงชาวบ้านส่วนใหญ่เป็นชาวป่าชาวเขา ซึ่งสมัยนั้นนิยมนับถือผีกันอยู่ ทำให้วัดแม่ตะไคร้ขาดผู้ทำนุบำรุงรักษา จนทรุดโทรมกลายสภาพเป็นวัดร้างในที่สุด กระทั่งต่อมา ครูบาอิ่นคำ คำภีระปัญโญ (ท่านเป็นลูกศิษย์ของครูบาเจ้าศรีวิชัย นักบุญแห่งล้านนาไทย) ธุดงค์เดินผ่านมาทางนี้ ท่านจึงได้อยู่จำพรรษาและเริ่มต้นบูรณะวัดขึ้นมาใหม่