ตามที่คณะรัฐมนตรีมีมติให้กรมศิลปากรดำเนินการโครงการจัดตั้งพิธภัณฑสถานแห่งชาติ ประจำเมือง ตั้งแต่ปี พ.ศ.2535 เป็นต้นมา เพื่อให้ท้องถิ่นเกิดความรักความภาคภูมิใจในความเป็นมาของท้องถิ่นตน และจะได้ร่วมกันรักษามรดกวัฒนธรรมที่มีค่าให้คงอยู่สืบไป จากนั้นในปี พ.ศ.2537 ผู้ว่าราชการจังหวัดชุมพร (นายประยูร พรหมพันธ์)ได้มอบที่ดินจำนวน 7 ไร่เศษ ณ พื้นที่ตำบลนาชะอัง อำเภอเมือง จังหวัดชุมพรให้แก่กรมศิลปากร เพื่อดำเนินการก่อตั้งพิพิธภัณฑสถานแห่งชาติ ชุมพร การก่อสร้างเริ่มขึ้นตั้งแต่ปี 2538 2540 โดยมีความมุ่งหวังให้เป็นพิพิธภัณฑสถานแห่งชาติที่ทันสมัย มีส่วนให้บริการมากขึ้น การจัดแสดงเน้นในการนำอุปกรณ์สารสนเทศมาใช้ เพื่อให้ผู้ใช้บริการมีส่วนร่วมกับการชมนิทรรศการมากกว่าเดิม อันจะทำให้ได้รับความรู้และความเพลิดเพลินในการเข้าชมมากเป็นพิเศษ สมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯ เสด็จเป็นประธานในพิธีเปิดอย่างเป็นทางการเมื่อวันที่ 30 เมษายน พ.ศ.2542