เกิดขึ้นในยุคเมืองโบราณริมฝั่งแม่น้ำโขงภายในวัดจะมีบ่อนำโบราณและต้นไม้ใหญ่ขนาดหลายคนโอบมีต้นตาลอายุ 1,000 ปี วัดตามวงรอบปี ซึ่งต้นไม้เหล่านี้คงเป็นพยานอ้างอิงทางธรรมชาติถึงความเก่าแก่ของวัดและในวัดยังมีพระพุทธรูปหินโบราณยุคสุโขทัย 2 องค์ลักษณะสร้างฐานติดกับพื้นดินไม่สามารถโยกย้ายได้นั่นคือการสร้างพระในรุ่นอดีตจะหล่อสร้างติดฐานเลย บ้านหนองจันทร์ในอดีตก็คือเมืองมรุขนครเกิดขึ้นในช่วงรัชกาลที่ 3 ของสยาม ก่อนที่จะย้ายเมืองเข้ามาอยู่ที่บ้านโพธิ์คำซึ่งเป็นเขตเทศบาลเมืองนครพนมปัจจุบันนี้ ก่อนจะเปลี่ยนชื่อเป็นจังหวัดนครพนม ดังนั้นวัดนี้จึงเก่าแก่มากรวมทั้งบ้านหนองจันทร์นี่ด้วย โดยเฉพาะวัดท่าหนังจันทร์ได้ผ่านการเป็นวัดร้างมาหลายครั้งไม่มีพระมาอยู่ซึ่งพระมนตรีก็ได้มาจำพรรษาพร้อมพัฒนามา 7 ปีนี้เอง ด้วยความร่วมมือร่วมใจชาวบ้านโดยร่วมกับสำนักงานวัฒนธรรมนครพนมพัฒนาเป็นแหล่งท่องเที่ยวเมืองโบราณด้วย