สวนสัตว์ขอนแก่นเดิม ชื่อว่า อุทยานสัตว์ป่าอีสานตอนบนขอนแก่น–อุดรธานี"" และใช้ชื่อนั้นเรื่อยมา จนกระทั่งเมื่อวันที่ 26 มิถุนายน 2556 กรรมการองค์การสวนสัตว์ ได้มีมติให้เปลี่ยนชื่อมาเป็น ""สวนสัตว์ขอนแก่น"" พร้อมทั้งให้สวนสัตว์ขอนแก่นเปิดบริการเก็บค่าบัตรผ่านประตูสวนสัตว์ขอนแก่นบริหารจัดการพื้นที่ภายใน แบ่งออกเป็น 2 ส่วน คือ ส่วนการศึกษา จัดให้เป็นแหล่งเรียนรู้และศึกษาทางด้านการอนุรักษ์พันธุ์สัตว์ป่าหายาก เป็นศูนย์วิจัยเพาะเลี้ยง และเป็นการท่องเที่ยวแบบอัธยาศัย รวมทั้งกิจกรรมการเดินป่าศึกษาธรรมชาติ กิจกรรมโครงการนักเรียนเข้าเรียนรู้ในสวนสัตว์ โครงการแค้มป์ปิ้ง โครงการกิจกรรมค่ายลูกเสือและยุวกาชาด รวมถึงศูนย์ประชุมสัมมนา ส่วนจัดแสดงสัตว์ Zoo Zone จัดเป็นแบบลักษณะสวนสัตว์ปิด ไม่สามารถนำรถยนต์เข้าไปเที่ยวชมได้ ซึ่งทางสวนสัตว์ได้จัดเตรียมพาหนะไว้บริการ คือ รถออโต้แทรม รถจักยานบริการ รถกอล์ฟบริการ และการเดินชมสัตว์ตามเส้นทาง