เดิมมีสภาพรกร้างเต็มไปด้วยป่าไม้และสัตว์ป่า ใน ปี พ.ศ.2507 พระครูนิมิตรสิทธิการ(หลวงพ่อเป้า เขมกาโม) มาจำพรรษาที่บริเวณถ้ำเขาตะบองนาค มีพุทธศาสนิกชนเลื่อมใสศรัทธาช่วยกันปรับปรุงภายในถ้ำและนอกถ้ำและบริจาคจตุปัจจัย หลวงพ่อได้นำมาใช้ในการพัฒนาถ้ำและสร้างถาวรวัตถุ เริ่มต้นด้วยการสร้างบ่อน้ำ สร้างบันไดทางเข้าถ้ำ สร้างกุฏิ โบสถ์ ศาลา ในปี พ.ศ.2537 พระสมพงษ์ ทองแฉล้ม(พระครูใบฎีกาสมพงษ์ กิตติสจโร เจ้าอาวาสวัดถ้ำพรสวรรค์ปัจจุบัน) ได้ปรับปรุงสภาพวัดโดยเทพื้นปูหินอ่อนเพื่อพัฒนาให้เป็นแหล่งท่องเที่ยวเชิงอนุรักษ์จัดสร้างพิพิธภัณฑ์สัตว์น้ำจืด น้ำทะเล และจัดประเพณีลอยกระทงในถ้ำโดยใช้วัสดุธรรมชาติ ใช้ดอกไม้สด ในวันเข้าพรรษา จัดกิจกรรมปลูกป่า อนุรักษ์ทรัพยากรธรรมชาติ เป็นประจำทุกปี