ศูนย์พัฒนาโครงการหลวงแม่แฮก่อตั้งขึ้นเมื่อ พ.ศ. 2521 พระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัวทรงมีพระราชดำริให้พัฒนาอาชีพของประชากรชาวเขาหมู่บ้านแม่แฮและหมู่บ้านใกล้เคียง เพื่อพัฒนาชุมชนแบบผสมผสานบนพื้นที่สูง เพื่อยกระดับความเป็นอยู่ของชาวเขา และนำผลจากการวิจัยเกษตรที่สูงไปถ่ายทอดและส่งเสริมแก่ชาวเขา เพื่อทดแทนการปลูกฝิ่นและการทำไร่เลื่อนลอย