ศูนย์ศึกษาเรียนรู้ระบบนิเวศป่าชายเลน สิรินาถราชินี ถือเป็นศูนย์เรียนรู้แห่งแรกในประเทศไทยสำหรับด้านการฟื้นฟูป่าชายเลนจากนากุ้งร้าง เดิมทีเป็นพื้นที่นากุ้งที่ได้รับสัมปทาน อยู่ในเขตป่าสงวนแห่งชาติป่าคลองเก่า–คลองคอย ต.ปากน้ำปราณ อ.ปราณบุรี จ.ประจวบคีรีขันธ์ ด้วยน้ำพระราชหฤทัยของพระบาทสมเด็จพระบรมชนกาธิเบศร มหาภูมิพลอดุลยเดชมหาราช บรมนาถบพิตร (รัชกาลที่ 9) และสมเด็จพระนางเจ้าสิริกิติ์พระบรมราชินีนาถ พระบรมราชชนนีพันปีหลวง เมื่อครั้งเสด็จพระราชดำเนินมาที่ปราณบุรี ทางกรมป่าไม้ได้สนองพระราชดำริด้วยการยกเลิกสัมปทานนากุ้ง แล้วรวมเป็นส่วนหนึ่งของโครงการพัฒนาป่าไม้ปากน้ำปราณบุรีอันเนื่องมาจากพระราชดำริ พร้อมกับเร่งฟื้นฟูพื้นป่าชายเลนและยังกำหนดให้เป็นพื้นที่ในการปลูกป่าและพัฒนาเพื่อเป้าหมายในการสร้างให้เป็นศูนย์การเรียนรู้ระบบนิเวศป่าชายเลนในเวลาต่อมา